Příběh hry The Division se odehrává v New Yorku 3 týdny poté, co se městem prohnal smrtící virus. Základní služby selhaly jedna po druhé. Společnost upadla do chaosu. Prezident vydal nařízení číslo 51, které aktivovalo přísně tajnou soběstačnou skupinu agentů s názvem The Division. Agenti Divize mezi námi žijí zdánlivě obyčejné životy, ale jsou vycvičeni, aby dokázali v podobných nouzových situacích jednat bez závislosti na velení. Když světla zhasnou, mise agentů začíná.
Během boje proti pádu společnosti se agenti ocitnou chyceni v obrovské epické konspiraci, kde budou bojovat nejen proti člověkem stvořenému viru, ale zvednou krk hlavně těm, kteří za tím vším stojí. Když už všechno padne, Vaše mise právě začíná.
Žijeme v křehkém a komplexním světě, síti na sobě závislých systémů, na které se spoléháme každý den. Když jeden padne, ostatní následují, což vytváří devastující domino efekt, který dokáže zničit společnost během pár dní. Ve hře Tom Clancy 's The Division se můžete ocitnout právě v takovém městě, kde všechno selhalo. Jako agent The Division, je Vaší misí navrátit zpět řád a spojit se s dalšími agenty a získat zpět New York.